Le gène SETD2 aide vos cellules à empaqueter correctement l’ADN, à contrôler les gènes actifs et à réparer les lésions de l’ADN. Lorsqu’il ne fonctionne pas correctement, les cellules peuvent se développer de manière moins contrôlée ou commettre davantage d’erreurs lors de la réplication. Ce gène joue un rôle important dans la croissance normale et le développement du cerveau. Les variants pathogènes du gène SETD2 peuvent provoquer une affection associant une croissance excessive, un retard du développement et des difficultés d’apprentissage, et des variants acquis de SETD2 sont également retrouvés dans plusieurs cancers.
Qu'est-ce qu'un gène?
Les gènes sont des segments d’ADN qui contiennent les instructions que vos cellules utilisent pour fabriquer des molécules ou réguler des processus dans l’organisme. Certains gènes portent les instructions nécessaires à la production de protéines, qui sont les éléments des cellules chargés d’effectuer le travail. D’autres aident principalement à contrôler quand certains processus se produisent, où ils se produisent et à quel point ils sont actifs. Pris ensemble, les gènes influencent le développement et le fonctionnement de l’organisme, et ils peuvent influer sur votre réponse à l’alimentation, au stress ou aux médicaments. Pour aller plus loin sur ce sujet, vous pouvez trouver davantage d’informations dans LearnHub.
Aperçu
SETD2Fonction du gène
Que se passe-t-il si le gène fonctionne?
Le gène SETD2 aide les cellules à compacter l’ADN et à activer ou désactiver d’autres gènes au bon moment. Il participe également à la réparation de l’ADN et à la copie fidèle de l’information génétique lors de la division cellulaire.
Risque
Que se passe-t-il si le gène ne fonctionne pas?
Des variants héréditaires du gène SETD2 peuvent provoquer une affection de surcroissance et du neurodéveloppement, souvent associée à un retard du développement ; des variants plus légers ou plus sévères peuvent modifier l’âge d’apparition des signes et leur degré d’expression. Des variants acquis sont également associés à certains cancers.
Traitement
Qu'est-ce que cela signifie pour ton traitement?
Aucun traitement ni aucune approche de prise en charge spécifique du gène SETD2 n’est actuellement établi pour les personnes porteuses d’une variante pathogène. Dans la recherche sur le cancer, la perte du gène SETD2 est étudiée comme biomarqueur et cible thérapeutique potentielle, en particulier dans le cancer du rein et certains cancers du sang.
Conditions associées à SETD2
Fonction du gène
Que se passe-t-il si le gène fonctionne?
Dans de nombreuses cellules, le gène SETD2 contribue à maintenir une organisation correcte de l’activité génétique quotidienne et le bon fonctionnement de l’ADN. Sa protéine ajoute une petite modification chimique aux protéines qui emballent l’ADN, ce qui aide les cellules à lire les gènes, à traiter les messages d’ARN et à assurer la réparation. Comprendre le fonctionnement du gène SETD2 peut aider à voir plus clairement comment les cellules restent stables pendant la croissance et le renouvellement normaux.
Le gène SETD2 ajoute une petite modification chimique aux histones, les protéines qui enroulent et organisent l’ADN. Cette modification aide les cellules à repérer les segments d’ADN qui sont activement utilisés.
Cette modification des histones aide la machinerie de lecture de la cellule à progresser de façon ordonnée à travers les gènes actifs. Elle soutient une activité génétique régulière afin que les bonnes instructions cellulaires puissent être copiées en ARN.
Après la lecture d’un gène, le message d’ARN doit encore être modifié avant de pouvoir guider la fabrication des protéines. Le marquage lié à SETD2 aide les cellules à couper et à réunir ces messages aux bons endroits.
Le même système de marquage aide à diriger les protéines de réparation vers les zones qui nécessitent une attention. C’est l’une des façons dont le gène SETD2 aide à réparer l’ADN lorsque les cellules font face à l’usure normale.
Qu'est-ce qu'une variante?
Une variante génétique est une modification mineure de la séquence d’ADN d’un gène. Ces modifications sont fréquentes et font partie de la diversité humaine normale, y compris les différences d’apparence, de métabolisme et de la manière dont l’organisme réagit aux influences environnementales. De nombreuses variantes n’ont aucun effet perceptible et font simplement partie de la variation génétique naturelle. Parfois, toutefois, une variante modifie plus significativement le fonctionnement d’un gène et peut contribuer à une affection génétique, ou en être la cause.
Variantes génétiques
Que se passe-t-il si le gène ne fonctionne pas?
De nombreuses variantes du gène SETD2 raccourcissent la protéine ou modifient la partie qui assure sa fonction chimique, de sorte que les cellules ajoutent moins d’une marque chimique importante aux protéines d’empaquetage de l’ADN. Cela peut affaiblir la réparation de l’ADN et rendre moins contrôlée la lecture des gènes. Les variantes plus légères peuvent laisser subsister une certaine activité, tandis que les variantes plus sévères peuvent la réduire fortement ou l’abolir, et elles sont souvent associées à des signes plus précoces ou plus marqués dans les affections liées à SETD2.
Comment les variantes sont liées aux conditions
Les variants pathogènes du gène SETD2 sont à l’origine du syndrome de Luscan-Lumish, une affection associée à une grande taille, une augmentation du périmètre crânien, un retard du développement, des difficultés d’apprentissage et parfois des traits autistiques. Lorsque les médecins évoquent les variants du gène SETD2 et les affections associées, il s’agit du principal diagnostic héréditaire bien établi. Des variants acquis de SETD2 sont également retrouvés dans certains cancers, en particulier le cancer du rein et certains cancers hématologiques, mais ces altérations tissulaires sont différentes de l’héritage d’un variant de SETD2.
Une variante n'est pas nécessairement un diagnostic
Les variants génétiques font partie intégrante de la biologie humaine et sont fréquents dans la population générale. La plupart n’ont pas d’effet direct sur la santé et relèvent plutôt de la diversité humaine normale. Pour de nombreux gènes, la présence d’un variant associé à une affection indique un lien possible plutôt qu’un diagnostic certain, surtout lorsque plusieurs gènes et des facteurs environnementaux sont également en jeu. Dans certaines situations, cependant, un variant bien caractérisé dans un gène donné peut suffire à confirmer un diagnostic.
Y a-t-il des choses qui peuvent augmenter ou modifier mon risque?
Il n’existe pas encore de données largement confirmées sur des facteurs spécifiques qui augmentent ou réduisent les risques pour la santé liés au gène SETD2. Pour de nombreuses personnes porteuses d’une modification de SETD2, le risque dépend surtout de la modification précise du gène elle-même et des antécédents personnels ou familiaux ; discuter de votre situation avec un médecin ou un conseiller en génétique peut aider à replacer ce risque dans son contexte.
Hérédité des variantes de SETD2
Pour la principale affection héréditaire liée au gène SETD2, les variants liés à SETD2 sont transmis selon un mode autosomique dominant. Cela signifie qu’un parent porteur d’un variant pathogène dans une copie du gène SETD2 peut le transmettre à un enfant avec un risque de 50 % à chaque grossesse, quel que soit le sexe. Dans les familles qui s’interrogent sur la transmission des variants de SETD2, il est également important de savoir que certaines personnes ont un variant nouveau, de novo, qui n’a été hérité d’aucun des deux parents. Une fois présent, ce variant peut alors être transmis selon un mode autosomique dominant.
Que signifie mon résultat SETD2 pour ma famille?
Une variation délétère du gène SETD2 est généralement liée à un mode de transmission dominant, de sorte que les apparentés au premier degré, comme les parents, les frères, les sœurs et les enfants, peuvent également porter la même variation. Chaque enfant d’une personne porteuse d’une variation pathogène de SETD2 a 1 chance sur 2, soit 50 %, d’en hériter. Certaines variations de SETD2 surviennent de novo chez une personne, de sorte qu’un parent peut ne pas porter cette variation.
Information génétique
Tests génétiques
Comment découvrir les variantes
Pour savoir si vous portez une variante du gène SETD2, les médecins réalisent un test génétique à la recherche de variantes de SETD2 sur un échantillon de sang ou de salive, et parfois sur du tissu tumoral. Un laboratoire lit le code ADN pour rechercher des modifications. Les résultats peuvent montrer si une variante est présente et si elle est héréditaire ou limitée à la tumeur.
Quand devrais-je envisager un test génétique?
Un test génétique du gène SETD2 peut être envisagé lorsqu’un enfant présente une croissance excessive inhabituelle, un périmètre crânien supérieur à la moyenne et des troubles du développement ou des difficultés d’apprentissage, en particulier si un trouble du spectre de l’autisme est également présent. Il peut aussi être utile lorsqu’un proche parent a une variante confirmée de SETD2 ou un diagnostic lié à ce gène.
Un résultat génétique n'est qu'une partie de ton histoire de santé
Un résultat génétique peut fournir des informations précieuses, mais la quantité d’éléments qu’il révèle dépend de l’affection et du type de variant en cause. De nombreux facteurs, dont le mode de vie, l’environnement, l’âge et les antécédents médicaux, influencent le fonctionnement de l’organisme au fil du temps. Pour certaines affections, en particulier celles influencées par de nombreux gènes, les informations génétiques apportent un contexte plutôt qu’une certitude et s’interprètent au mieux en parallèle avec les autres éléments de la prise en charge. Dans d’autres situations, un résultat génétique peut apporter une réponse claire. Dans des domaines comme la réponse aux médicaments, les résultats génétiques peuvent aussi aider à replacer les expériences individuelles dans leur contexte.
Pharmacogénétique
Comment les variantes influencent ta réponse aux médicaments
La variation génétique peut influencer la façon dont votre organisme répond aux médicaments. Chez certaines personnes, un médicament est métabolisé plus rapidement ou plus lentement que prévu, tandis que d’autres peuvent être plus ou moins sensibles à ses effets. Cela aide à expliquer pourquoi un même traitement peut bien fonctionner chez une personne, avoir moins d’effet chez une autre ou provoquer davantage d’effets indésirables chez quelqu’un d’autre.
Qu'est-ce que la pharmacogénétique?
La pharmacogénétique examine comment les différences dans les gènes d’une personne influencent sa réponse aux médicaments. Elle étudie les liens entre les gènes et les médicaments afin d’aider à expliquer pourquoi un même traitement peut agir différemment selon les personnes. Pour de nombreux médicaments, les gènes influencent l’intensité de l’effet d’un médicament ou la manière dont l’organisme le traite. Ces informations peuvent orienter des choix thérapeutiques mieux éclairés et plus personnalisés. Vous trouverez plus de détails sur ce sujet dans le LearnHub.
Médicaments influencés par le gène SETD2
Quand dois-je consulter un médecin?
Il n’existe pas encore de rôle largement confirmé pour ce gène dans le choix d’un médicament ou d’une dose. Les questions concernant les effets indésirables, de nouveaux signes ou la manière dont un médicament peut agir chez vous sont à discuter de préférence avec votre médecin. Les recherches sur SETD2 se poursuivent, en particulier dans le cancer, où des modifications de ce gène peuvent influencer la réponse de certaines tumeurs à certains traitements, mais cela ne constitue pas encore une recommandation standard pour la prescription.
Histoire
SETD2 a été mis en évidence au moment où les chercheurs travaillaient à cartographier les gènes impliqués dans la croissance cellulaire et le cancer. Au cours des dernières décennies, la connaissance du rôle de ce gène s’est développée à mesure que des études reliaient des modifications de SETD2 au cancer du rein et à plusieurs autres affections. Il a d’abord été étudié sous un autre nom, HYPB, avant que les scientifiques ne le reconnaissent comme SETD2 et ne précisent sa place dans la génétique humaine. Dans le prolongement de ces premiers travaux, les scientifiques ont découvert davantage d’éléments sur ce gène grâce à de vastes projets de séquençage du cancer menés dans les années 2010, qui ont montré que des variants de SETD2 apparaissent à plusieurs reprises dans certaines tumeurs. Ces constatations ont contribué à faire passer SETD2 du statut de cible de recherche peu connue à celui d’élément établi de la génétique moderne du cancer.