Le gène AGXT aide le foie à dégrader le glyoxylate afin qu’il ne se transforme pas en trop grande quantité d’oxalate, une substance pouvant former des cristaux. Si ce gène ne fonctionne pas correctement, l’oxalate peut s’accumuler et provoquer des calculs rénaux à répétition, des dépôts de calcium dans les reins et, à terme, une atteinte rénale. En médecine, ce gène est important car des variants pathogènes peuvent causer une hyperoxalurie primitive de type 1. Certaines personnes développent également une accumulation d’oxalate dans d’autres parties du corps lorsque la fonction rénale diminue.
Qu'est-ce qu'un gène?
Les gènes sont des segments d’ADN qui donnent à vos cellules des instructions pour fabriquer des molécules ou orienter les activités de l’organisme. Certains gènes portent le code des protéines, qui assurent la majeure partie du travail cellulaire. D’autres régulent principalement le moment où certains processus se produisent, l’endroit où ils ont lieu et leur niveau d’activité. Ensemble, les gènes influencent le développement et le fonctionnement de l’organisme, et ils peuvent aussi influencer votre réponse à l’alimentation, au stress ou aux médicaments. Pour aller plus loin sur ce sujet, vous pouvez en savoir plus dans le LearnHub.
Aperçu
AGXTFonction du gène
Que se passe-t-il si le gène fonctionne?
Le gène AGXT aide votre foie à métaboliser le glyoxylate, un composé chimique naturel produit au cours du métabolisme normal. Cela limite l’accumulation d’oxalate et soutient les reins en réduisant le risque de formation de cristaux.
Risque
Que se passe-t-il si le gène ne fonctionne pas?
Les variants du gène AGXT peuvent provoquer une hyperoxalurie primitive de type 1, avec une production excessive d’oxalate. Cela entraîne souvent des calculs rénaux récidivants et peut aller d’une atteinte rénale plus légère jusqu’à une insuffisance rénale précoce, parfois avec une accumulation d’oxalate dans d’autres organes.
Traitement
Qu'est-ce que cela signifie pour ton traitement?
Les variants pathogènes du gène AGXT peuvent influer sur le choix du traitement, car certains répondent à la pyridoxine (vitamine B6), qui peut abaisser les taux d’oxalate ; la réponse est particulièrement observée avec certains variants d’AGXT. Le lumasiran est un traitement établi de l’hyperoxalurie primitive de type 1, quel que soit le variant spécifique d’AGXT, et il contribue à réduire la production d’oxalate.
Conditions associées à AGXT
Fonction du gène
Que se passe-t-il si le gène fonctionne?
Votre foie utilise le gène AGXT pour métaboliser le glyoxylate, une petite substance chimique produite au cours des processus biochimiques quotidiens de l’organisme. Sa protéine aide à transformer le glyoxylate en glycine, un acide aminé, et contribue à une production équilibrée d’oxalate. Il s’agit d’un élément clé de la façon dont le foie prend en charge le glyoxylate lors de l’activité cellulaire habituelle.
Le gène AGXT aide les cellules du foie à convertir le glyoxylate en glycine, un acide aminé que votre organisme utilise chaque jour. Cela oriente le glyoxylate vers une voie de métabolisme routinière et bien régulée.
Sa protéine transfère un petit groupement chimique de l’alanine, un acide aminé, vers le glyoxylate. Cette étape forme du pyruvate, que les cellules peuvent utiliser pour produire de l’énergie, et de la glycine.
Le gène AGXT contribue à un équilibre normal de l’oxalate en orientant le glyoxylate vers cette voie hépatique. Cela aide à mieux contrôler la biochimie quotidienne de l’organisme.
La protéine AGXT agit principalement dans les peroxysomes, de petits compartiments situés à l’intérieur des cellules du foie. Cet emplacement aide la cellule à métaboliser le glyoxylate au bon endroit.
Qu'est-ce qu'une variante?
Une variante génétique est une différence mineure dans la séquence d’ADN d’un gène. Les variants sont fréquents et contribuent à façonner la diversité humaine normale, notamment les différences d’apparence, de métabolisme et de la manière dont l’organisme réagit aux influences environnementales. Beaucoup n’ont aucun effet perceptible et ne font que faire partie de la variation génétique naturelle. Parfois, toutefois, un variant peut modifier de façon plus importante le fonctionnement d’un gène et peut contribuer à une maladie génétique ou en être la cause.
Variantes génétiques
Que se passe-t-il si le gène ne fonctionne pas?
Les variants du gène AGXT peuvent réduire la quantité d’enzyme fonctionnelle, la rendre instable ou l’acheminer vers une mauvaise partie de la cellule ; c’est ainsi que les variants du gène AGXT affectent l’activité enzymatique. Certaines modifications laissent persister une activité partielle, tandis que les variants plus délétères peuvent la presque abolir. Cette gamme de variants, allant des plus modérés aux plus sévères, aide à expliquer pourquoi l’hyperoxalurie primitive de type 1 peut apparaître plus tard et rester plus légère chez certaines personnes, mais débuter plus tôt ou provoquer des manifestations plus marquées chez d’autres.
Comment les variantes sont liées aux conditions
Des variants pathogènes du gène AGXT sont responsables de l’hyperoxalurie primitive de type 1, une maladie héréditaire rare associée à des calculs rénaux récidivants, à une accumulation d’oxalate de calcium et à une atteinte rénale. Chez certaines personnes, les variants du gène AGXT associés à l’hyperoxalurie primitive de type 1 entraînent aussi une accumulation d’oxalate dans les os, les yeux, la peau, les vaisseaux sanguins ou le cœur, surtout après une dégradation de la fonction rénale. Un variant pathogène confirmé du gène AGXT peut établir le diagnostic dans un contexte clinique évocateur.
Une variante n'est pas nécessairement un diagnostic
Les variantes des gènes font partie du fonctionnement normal de la biologie humaine et se retrouvent dans l’ensemble de la population générale. La plupart n’ont pas d’effet direct sur la santé et ne contribuent qu’à la variation humaine normale. Pour de nombreux gènes, une variante associée à une affection indique un lien possible plutôt qu’un diagnostic certain, en particulier lorsque plusieurs gènes et des facteurs environnementaux jouent un rôle. Dans certaines situations, toutefois, une variante bien comprise dans un gène particulier suffit à confirmer un diagnostic.
Y a-t-il des choses qui peuvent augmenter ou modifier mon risque?
Pour AGXT, le risque est principalement déterminé par l’hérédité : il est le plus élevé lorsque les deux parents portent une copie modifiée et qu’un enfant hérite des deux copies modifiées. Chez les personnes vivant déjà avec une affection liée à AGXT, la déshydratation peut augmenter le risque de calculs rénaux et de lésions rénales.
Hérédité des variantes de AGXT
L’hérédité du gène AGXT dans l’hyperoxalurie primitive de type 1 suit un mode autosomique récessif. Cela signifie qu’un enfant hérite généralement d’une variante du gène AGXT de chacun de ses parents, et que les parents porteurs d’une seule variante n’ont généralement pas eux-mêmes la maladie. Lorsque les deux parents sont porteurs, chaque grossesse a 25% de risque d’avoir un enfant atteint, 50% de risque d’avoir un enfant porteur et 25% de risque d’avoir un enfant ne présentant aucune des deux variants familiales. Comme le gène AGXT est situé sur le chromosome 2, il se transmet de manière égale par l’une ou l’autre branche de la famille.
Que signifie mon résultat AGXT pour ma famille?
Pour les familles, un résultat AGXT est généralement surtout important pour les frères et sœurs, ainsi que pour les proches qui envisagent d’avoir des enfants. Les parents d’une personne atteinte d’hyperoxalurie primitive de type 1 sont généralement des porteurs sains, et les frères ou sœurs peuvent eux aussi être atteints ou porteurs. D’autres proches peuvent également porter le gène modifié, de sorte que cette découverte peut avoir une portée pour l’ensemble de la famille.
Information génétique
Tests génétiques
Comment découvrir les variantes
Les médecins utilisent souvent le test génétique AGXT pour l’hyperoxalurie primitive de type 1 sur un échantillon de sang ou de salive. Le laboratoire analyse le gène AGXT afin de rechercher des variants et peut également vérifier l’absence ou l’excès de fragments d’ADN. Les résultats peuvent montrer si une personne ne présente aucun variant pertinent, est porteuse d’un variant, ou présente deux variants qui étayent le diagnostic.
Quand devrais-je envisager un test génétique?
Envisagez un test génétique de l’AGXT si vous ou votre enfant présentez des calculs rénaux récidivants, un dépôt de calcium dans les reins ou une insuffisance rénale inexpliquée, en particulier à un jeune âge. Il peut aussi être utile lorsqu’une hyperoxalurie primitive, une affection rare qui entraîne un excès d’oxalate, est présente dans la famille.
Un résultat génétique n'est qu'une partie de ton histoire de santé
Un résultat génétique peut fournir des informations utiles, mais la quantité d’éléments qu’il révèle dépend de l’affection et du type de variant en cause. Le fonctionnement de l’organisme au fil du temps est influencé par de nombreux facteurs, notamment le mode de vie, l’environnement, l’âge et les antécédents médicaux. Pour certaines affections, en particulier celles influencées par de nombreux gènes, les informations génétiques apportent un contexte plutôt qu’une certitude et il est préférable de les interpréter conjointement avec les autres volets de la prise en charge. Dans d’autres situations, un résultat génétique peut apporter une réponse claire. Dans des domaines comme la réponse aux médicaments, les résultats génétiques peuvent aussi aider à replacer les expériences individuelles dans leur contexte.
Pharmacogénétique
Comment les variantes influencent ta réponse aux médicaments
Les variations génétiques peuvent influencer la manière dont votre organisme répond aux médicaments. De petites différences dans les gènes peuvent modifier la vitesse à laquelle un médicament est dégradé, la quantité qui atteint sa cible, ou la sensibilité de votre organisme à ses effets. Cela aide à expliquer pourquoi un même médicament peut bien agir chez une personne, être moins efficace chez une autre, ou entraîner davantage d’effets indésirables chez quelqu’un d’autre. Ces différences sont fréquentes et constituent l’une des raisons pour lesquelles la réponse au traitement peut varier d’une personne à l’autre.
Qu'est-ce que la pharmacogénétique?
La pharmacogénétique étudie la manière dont les différences génétiques peuvent influencer la réponse d’une personne aux médicaments. En examinant les liens entre les gènes et les médicaments, elle aide à expliquer pourquoi un même traitement peut agir différemment d’une personne à l’autre. Pour de nombreux médicaments, les gènes peuvent influer sur l’intensité de l’action d’un médicament ou sur la façon dont l’organisme le métabolise. Ces informations peuvent contribuer à des décisions thérapeutiques plus personnalisées et mieux éclairées. Vous trouverez davantage d’informations à ce sujet dans LearnHub.
Médicaments influencés par le gène AGXT
Quand dois-je consulter un médecin?
Il n’existe pas encore de rôle largement confirmé pour ce gène dans les décisions thérapeutiques de routine ; il est donc préférable d’aborder les questions générales concernant les médicaments, les effets indésirables ou les compléments avec votre médecin. Chez les personnes vivant avec une hyperoxalurie primitive de type 1, les variations d’AGXT peuvent influencer l’efficacité du traitement par vitamine B6 ; il est donc utile d’en discuter avant de commencer ce traitement ou lors de sa réévaluation.
Histoire
L’hyperoxalurie primitive a été reconnue sur le plan clinique bien avant l’identification du gène AGXT, lorsque les médecins décrivaient des personnes qui développaient des calculs rénaux récidivants et une atteinte rénale liée à un excès d’oxalate. Dans les années 1980 et au début des années 1990, les chercheurs ont établi plus clairement un lien entre cette affection et une enzyme hépatique absente ou altérée, puis ont rattaché la cause au gène AGXT sur le chromosome 2. À partir de ces premières observations, la recherche s’est développée régulièrement. Les scientifiques ont ensuite montré que différentes variants d’AGXT pouvaient expliquer pourquoi certaines familles présentaient une maladie plus sévère, tandis que d’autres avaient une évolution plus tardive ou plus légère. Ces travaux ont contribué à établir l’hyperoxalurie primitive de type 1 comme une affection héréditaire distincte. Ils ont également posé les bases du diagnostic génétique moderne et du dépistage familial.