Menschen bemerken Metachondromatose oft zuerst im Kindesalter, wenn kleine, schmerzlose knöcherne Knubbel nahe der Basis der Finger oder Zehen auftreten, die manchmal die Finger nach innen krümmen. Ärztinnen und Ärzte können die ersten Anzeichen einer Metachondromatose auf Röntgenaufnahmen der Hände oder Füße erkennen, nachdem ein Elternteil neue Knoten oder leichte Veränderungen in der Fingerstellung bemerkt hat, während Wachstum und allgemeiner Gesundheitszustand meist unauffällig bleiben. Anders als bei anderen Erkrankungen mit knöchernen Vorwölbungen können sich diese Läsionen im Laufe der Zeit verkleinern und betreffen vor allem Hände und Füße, was Fachleuten hilft zu erkennen, wie Metachondromatose zunächst auffällt.